在飼養肉種公雞過程中，總會有一些體弱或者日齡較大的肉種雞，這類種公雞不能用于交配，在發現時必須淘汰或者調換，否則回影響種母雞的受精率。
1、淘汰不良公雞
如果種公雞數量較多，可及時淘汰掉不能使用的公雞，籠養種雞時可通過顯微鏡下檢測，將無精子或精子活力較低的公雞挑出去淘汰，平養種雞時可將公雞分成A、B、C三個群體，A群體中的公雞羽毛光亮，體重偏大，好爭斗，在雞群中處于優勢地位，它保護著母雞但并不會與母雞交配，而其它的公雞也不敢碰它的母雞;B群體中的公雞體重適中，雞冠紅潤而直立，兩眼明亮有神，羽毛光亮，行動敏捷，腿長有力，腹部無多余脂肪，不好爭斗。它們的體重一般比母雞重30%左右，體型上與母雞相配，并與母雞互相傾慕，所以受精率較高;C群體總的公雞羽毛臟亂不齊，體重偏小，雞冠萎縮，腿腳腫脹等，它雖然占有母雞但不能交配。由此可見，為了提高種蛋的受精率，及時淘汰A、C群體公雞，而選留優良的B群體公雞。
2、調換公雞
在實踐生產中，肉種雞產蛋后期往往供給數量不太充足，這樣就需要用新公雞來替換或補充，對要調換的公雞除滿足上述B群體公雞所具備的條件外，還應達到同品種健康無病，周齡最好在30-35周的要求。調換的的方法是：當天下午先將上述A、C群體的不良公雞挑出淘汰，一般占原公雞的40-50%，當天晚上待雞群安靜后，將要調換的公雞均勻，分散在整棟雞舍內，一般調換的公雞也占原公雞的40-50%，以保證調換后的公雞仍占母雞數的8-11%，這樣不僅可以避免公雞爭斗，還可以最大限度地提高種蛋受精率更換公雞后還應及時觀察雞群，挑出好斗的公雞。同時更換公雞易帶入新的細菌、病毒，所以在替換之前要對新公雞進行嚴格檢疫和隔離觀察，確保健康后方可轉人。
此外，如果沒有達到要求的富余公雞，也可采用棟和棟之間對半調換，使公雞沖動，也能提高受精率。進行調換的兩棟雞舍應是同品種健康無病的雞群，周齡也應最好相差不大。