(一)飲水消毒的重要性和目的 飲水是雞群疾病傳播的一個重要途徑。病雞可通過飲水系統將致病的病毒或細菌傳給健康的雞，從而引發呼吸系統、消化系統疾病。如果在飲水中加入適量的消毒藥物可以殺死水中帶有的細菌和病毒。飲水消毒主要可控制大腸桿菌、沙門氏菌、葡萄球菌、支原體及一些病毒性病原微生物。同時對控制飲水系統中的粘液細菌也極為有效。
(二)飲水消毒中消毒劑的選用 飲水消毒可以選擇的消毒劑種類很多，常用的有氯制劑、復合季銨鹽類等。消毒藥可以直接加入蓄水池或水箱中，用藥量應以最遠端飲水器或水槽中的有效濃度達到該類消毒藥的最適飲水濃度為宜。
(三)飲水消毒應注意的事項 (1)高濃度的氯可引起雞腹瀉，生產力下降，尤其在雛雞階段不能用超過10x10（的負6次方）的氯制劑飲水。而且氯對霉菌無作用，如果雞只發生嗉囊霉菌病時，需在水中加碘消毒，濃度為12x10（的負6次方）。(2)在飲水免疫、滴口免疫及噴霧免疫的前后2天，或飲水中加入其他有配伍禁忌的藥物時，應暫停飲水消毒。除此之外，飲水消毒在整個飼養期不應間斷。