配合飼料種類很多，因此，料型不同(顆粒料、粉料)儲藏方法也各不相同。
顆粒飼料的儲藏：顆粒飼料采用蒸汽(也有用水)制粒處理，能殺死絕大部分微生物和害蟲，而且含水量較低，維生素容易被光破壞。因此，顆粒飼料在儲藏期間必須保持干燥，包裝要用雙層袋，內用不透氣的塑料袋，外用紡織袋包裝。儲藏飼料的溫度要低于10攝氏度。
粉狀飼料的儲藏：粉狀配合飼料大部分是谷類，表面積大，孔隙度小，導熱性差，容易吸濕發霉。其中的維生素隨溫度升高而損失加大。維生素之間，維生素與礦物質的配合方法不同，其損失情況也有所不同。此外，光照也是造成維生素損失的主要因素之一。所以，粉狀飼料一般不宜久放，要盡快使用。一般在廠內存放時間不要超過1個月。
濃縮飼料的儲藏：這種飼料富含蛋白質，并含維生素和各種微量元素等營養物質。其導熱性差、易吸濕，因而微生物和害蟲易繁殖，維生素易受熱、氧化等因素的影響而失效。有條件時，可加入適量抗氧化劑。儲存時要放在干燥、低溫處。