空舍消毒遵循的程序，清掃、消毒、沖洗、熏蒸消毒。
一、清理雞舍 清舍速度要快，為保證消毒效果打下良好的基礎，為熏蒸消毒留有充足的時間，飼養設備搬到舍外：包括料桶、飲水器、塑料網、燈泡、溫濕度計、工作服及其他用具等。徹底清除雞舍糞便要求做到無雞糞、羽毛、煤灰等，清掃房頂、墻壁和門窗等，做到舍內無塵。
二、清洗雞舍 清洗地面和墻壁和門窗等，設備與舍外用消毒藥浸泡消毒，用清水沖洗干凈、曬干;要求地面無積水，舍內任何表面都要沖洗到，無污物附著。特別注意房頂的灰塵要清掃清洗要由上而下，設備及地面干燥后方可消毒，最好使用歐福或安特2000。
三、治理舍外環境 清除舍外排水溝雜物;清除雞舍四周雜草;做到排水暢通，不影響通風。修理舍外道路和清掃廠區。
四、雞舍消毒 把設備和用具搬進雞舍，關閉門窗和通風孔。要求做到封閉嚴密不漏風，噴灑消毒，消毒后10小時后通風，通風后3-4小時后關閉門窗。雞舍所有表面頂棚墻壁、網床選用高效、無腐蝕性的消毒藥。按說明書比例配置。地面選用3%熱火堿水噴灑或撒生石灰。
五、熏蒸消毒 關閉門窗和通風口，檢查溫度和濕度是否符合要求。最好選用固體甲醛與高猛酸鉀熏蒸法。具體要求是舍溫24℃，濕度80%，上述熏蒸藥物按雞舍面積計算，如高錳酸鉀21克、福爾馬林42毫升、水21毫升，劑量準確。走廊每隔10米做一個熏蒸盆。盆內放好高錳酸鉀加水攪勻。然后從舍內最遠端依次快速倒入福爾馬林，完成后立即把門封存嚴。空舍消毒期間不得有人、動物進入雞舍，熏蒸后24-36小時開門窗和通氣孔，全部打開，充分換氣。