養殖生產中，有很多污染源，人們第一想到的就是糞便污染。是的，糞便的污染首先是對空氣的污染，臭氣熏天，就說的這個。另外就是對水體的污染。雞場糞便污染水體，引起一系列綜合危害，如水質惡化不能飲用，水體富營養化造成魚類等動植物的死亡，湖泊的衰退與沼澤化，沿海港灣的赤潮等。不恰當使用糞便污水，也易引起土壤污染及食物中的硝酸鹽、亞硝酸鹽增加。
另外的重要污染源就是生物病原物。生物病院物主要包括雞場中的細菌、病毒、寄生蟲，它們有的通過水體，有的通過空氣傳染或寄生于雞只，有的通過土壤或附著于農產品進入體內。是疫病的源頭，也是潛在的危險。
另外，我們還有關注的污染物就是養雞場排放的氣體，主要是大量的含硫、含氨化合物或碳氧化合物排入大氣。還有蚊蠅孳生的污染。我們都知道蚊、蠅攜帶大量的致病微生物，對人和動物造成潛在的危害。