1.消毒劑的選擇。要選擇對重點預防的疫病有高效消毒作用的消毒劑，適合要消毒的對象，且有正式的文號和生產廠家，質量可靠。
2.稀釋濃度正確。藥液濃度是決定消毒劑對病原體殺傷力的第一要素，只有濃度正確才能充分發揮其消毒作用。對粘度大，難溶于水的藥劑要充分稀釋，做到濃度均勻。
3.藥液量足夠。要達到消毒效果，不用一定量的藥液將消毒對象充分濕潤是不行的，每立方米至少需要150-300毫升配制完成后的藥液。
4.有機物的存在會降低消毒效果。對欲消毒的地面、用具、設備、屋頂等均須事先消除有機物，沖洗干凈。
5.消毒藥與病原體的接觸時間。任何消毒劑都需要同病原體接觸一定的時間，才能將其殺死，一般為30分鐘。
6.溫度。消毒劑的消毒效果與溫度有關。一般溫度高時效果好;溫度低則殺毒作用弱、速度慢。所以消毒時應盡可能提高藥液或環境的溫度。消毒劑的效力通常以20℃、10分鐘作為比較標準。
7.PH值。由于沖洗不干凈，雞舍內的PH值偏高(約8—9)呈堿性，而在酸性條件下才能有效的消毒藥物此時其效果將受到影響。
8.水的質量。所有的消毒劑性能在硬水中都會受到不同程度的影響，如苯制劑、煤酚制劑會發生分解，降低其消毒效力。
消毒方法是否正確，清洗徹底程度如何，將會使消毒的效果產生天壤之別。這就要求我們在做消毒工作時，一定要控制好以上各種影響因素。如果消毒工作變成不可靠的例行公事，不但不會使病原體減少，相反，由于思想麻痹，將會為病原體的泛濫提供機會、創造條件，侵害雞群，無效的消毒水還很可能變成病原體的傳播媒介。