圈舍中常見的有害氣體主要有氨氣、硫化氫、一氧化碳、二氧化碳等。氨氣會刺激畜禽，導致打噴嚏，流涎，喪失食欲，易發呼吸道疾病;硫化氫、一氧化碳、二氧化碳的濃度過高，常常會導致食欲減退，抵抗力下降，嚴重時還會因中毒而死亡。
要保持畜禽舍內空氣清新，最好的辦法是開窗通風，及時排除舍內污濁的空氣，即使在冬季，也不要長期封閉門窗。但在冬季要注意：排除過多的水汽，使舍內空氣的相對濕度保持適宜狀態;維持適中的氣溫，不致發生劇烈變化;氣流穩定，不要形成賊風，要求整個圈舍內氣流均勻，無死角;清除空氣中的微生物、灰塵以及圈舍內的有害氣體和惡臭氣味;防止水汽在墻壁、天棚、用具上凝結。