雞舍整理完畢后2天~3天可對雞舍進行沖洗。沖洗時按照先上后下、先里后外的原則，保證沖洗效果和工作效率，同時還可以節約成本。沖洗的順序為：頂棚、籠架、料槽、糞板、進風口、墻壁、地面、儲料間、休息室、操作間、糞溝，防止已經沖洗好的區域被再度污染，墻角、糞溝等角落是沖洗的重點，避免形成“死角”;沖洗的廢水通過雞舍后部排出舍外并及時清理或發酵處理，防止其對場區和雞舍環境造成污染。
沖洗整理完畢后，對工作效果要進行檢查，儲料間、雞籠、糞板、糞溝、設備的控制開關、閘盒、排風口等部位均要進行檢查(每個部位至少取5個點以上)，保證無殘留飼料、雞糞及雞毛等污物。對于沖洗不合格的，應立即組織重新沖洗并再次進行檢查，直到符合要求。
對飲水管與籠具接觸處、線槽、料槽、電機、風機等沖洗不到或不易沖洗的部位進行擦洗。進入雞舍的人員必須穿干凈工作服、工作鞋;擦洗時使用清潔水源和干凈抹布;及時對抹布進行清洗;洗抹布的污水不能在雞舍內排放或潑灑，要集中到雞舍外排放。