筆者根據多年生產實踐，現已證實，許多蟹病的流行，特別是傳染性疾病與寄生蟲病的發生，都與藏污納垢的底質有關聯，而且底質對成蟹的色澤、鮮度也會產生直接影響。河蟹的排泄物和殘餌超出水體內細菌的最高負荷分解量時，除了一部分在水體中加劇水質的富營養化外，其余大部分廢物則沉積于池底，會產生一些有毒的還原性中間產物，進一步敗壞水質，并直接毒害河蟹。關于底質的調節與改良措施：
1、有條件的水體在投入前進行清淤、干曬。既利于殺滅病原體和改善土壤環境，又有利于河蟹的生長。
2、在使用化學改良劑時，應選擇沉水速度快的顆粒劑或片劑商品藥。如底質改良劑（顆粒）、三氯尿酸（片劑）。有效殺滅氨氮、硫化氫、亞硝酸鹽等有毒有害物質的含量。
3、使用微生物制劑，應強調壓底施入，有效降低水體中有毒有害物質，改良養殖水體環境。
4、種植的水草作為河蟹青飼料，宜選擇根系著生于底泥中的沉水植物（如輪葉黑藻、伊樂藻、苦草）。能大量吸收池塘底質淤泥營養，不但可以改善水質，而且改善底質。
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