在扣蟹養殖過程中，由于蟹池大量投喂，殘剩飼料以及河蟹的排泄物經過分解，加上池底土壤原有肥力對池水的緩慢釋放，使池水過肥。有些河蟹養殖戶見蟹池水質變肥，就急忙換水，以防不測，常出現一些應激反應，啟東市王鮑鎮示范戶楊衛東養殖扣蟹10多畝，全年不換水，但扣蟹產量高、不發病。
         
　　目前許多扣蟹養殖戶在生產上普遍采用進排水的方法來調節蟹池的肥度，這不是最佳辦法，因為過多的進排水，一是浪費電力，增加成本；二是流失水體中的有效成分，使池中肥力不足，降低池塘中的浮游植物和浮游動物的量，影響河蟹的生長；三是水位不定，河蟹洞穴變化頻繁，部分河蟹遷移水面以上不吃食、不蛻殼，形成“懶蟹”；四是進排水稍有疏忽易造成扣蟹逃逸，從而影響扣蟹的產量。
        
　　但是水質過肥后采取怎樣的方法來調節控制呢？主要采取以下方法：（1）栽植水生植物，如水花生。投放漂浮性水生植物，如大、小葉浮萍，可吸收水體中的肥力，控制浮游植物大量繁殖，同時可為扣蟹提供棲息、蛻殼、隱蔽的場所，又可提供植物性飼料，促進扣蟹生長，減少養殖成本。水生植物面積占池塘總面積的80%左右。（2）使用生物菌改良水質，使用生物菌可增加水體溶解氧，一般每隔7～10天使用1次，用量0.5公斤/畝。