本病由分解甲殼質和腐屑的細菌Benekeasp．所引起。有時伴隨有假單胞桿菌（Pseudomonas）和極毛桿菌（Aeromonas）。發病初期病灶處是較小的褐斑，以后病灶處逐漸潰爛，變為黑色。細菌腐蝕被破壞了的甲殼下面的組織，最常被細菌感染的部位是鰓絲，腹部腹面的肌肉，尾節和步足。病情嚴重的個體臥于池邊，只有腹足和鰓蓋在運動。
在沼蝦養殖過程中，黑斑病是一種最常見的疾病。疾病發生的過程，首先是甲殼遭到破環，其次是分解甲殼和腐屑的細菌侵入，最后是一種致命的淡水藻狀菌（Phycomycetous）的侵入，蔓延和發作，引起沼蝦死亡。用呋喃西林（Furanace）可以治療此病，但效果不穩定。預防措施主要是小心搬運，防止甲殼損傷；降低蝦的密度；不同水體的蝦不要互相混養。黑斑病不宜化學藥物進行預防。
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