在人工養殖過程中，南美白對蝦纖毛蟲病暴發較嚴重，直接影響對蝦的攝食、脫殼和生長。由此在管理中，依據科學的管理，減少病害的發生顯得尤為必要。暴發纖毛蟲病害原因有以下幾點：
（1）池塘養殖水溫升高。到了夏天高溫的養殖季節，水溫升高，纖毛蟲的活力及對寄主的感染能力都處于較高狀態，導致纖毛蟲的大量暴發。
（2）池塘中可溶解性的有機質增加，為單細胞纖毛蟲類的傳播提供了理想條件。在夏季，蝦生長速度快，攝食量比較大，隨著投喂的飼料增多，水體中的處在富營養化的狀態中，水體中的有機質多。
南美白對蝦養殖戶在養殖的過程中，見到纖毛蟲的暴發，常選擇潑灑殺蟲劑藥物，這種藥物治療，只起到治標不治本的效果，且容易對對蝦產生刺激。所以，在養殖過程中，防治纖毛蟲病的發生要做到：
（1）保持水體的清爽，勤改底。一般在放苗之前，池塘都有清塘、消毒，池底的有機碎屑少，隨著養殖過程的深入，池中的有機碎屑增多，池底也逐漸的沉積蝦的糞便及殘余餌料，所以要施用分解型的底改“底巧”；在養殖中期，池底的氧化還原電位不斷的降低，池底容易出現發黑、發臭，間隔施用“底安生+底生氧”來提高池底的電位，防止發黑，發臭現象，同時結合使用“利生素”或者“生態寶”。
（2）混養攝食池底有機質的魚類，例如青魚，羅非魚等。
總之，池塘系統的破壞主要是由人工投喂的飼料造成的，合理的投喂飼料以及對底部土質的改良是防治纖毛蟲病的有效手段。