亞甲基藍，又名堿性湖藍，次甲基藍，美藍，分子式為：C16H18ClN3S•3H2O，是一種綠色，有光澤的柱狀結晶或結晶性粉末。無臭，露置空氣中無變化，易溶于水及醇。亞甲藍藥性溫和，用起來較為放心，它還有助于提高魚類的呼吸功能。
亞甲基藍用途比較廣泛，第一，與鹽一起使用時可以防治水霉病，第二頁可以防治爛尾病;第三是一些寄生蟲病，如車輪蟲、小瓜蟲、口絲蟲、斜管蟲等原蟲性疾病和三代蟲、指環蟲以及皮膚和鰓部的寄生蟲病，另外還可以治療三代蟲引起的黏液性皮膚病。
具體使用辦法如下：
一、浸浴法。
1、使用濃度為10毫克/升溶液浸洗10~20分鐘，可以防止水霉病。
二、潑灑法。
1、使池水中藥物濃度達到2~3毫克/升，隔一天再使用1次，連用2次，可以治療各種海淡水的水霉病和河蟹的鏈壺菌病。
2、在池水中將呋喃噠嗪和亞甲基藍的濃度分別達到5毫克/升和1毫克/升，可以治療鯉魚水霉病有較好的效果。
3、2~3毫克/升濃度，2~3天使用一次，連續使用3~4天，可以治療無鱗魚(鰻鱺科)水霉病和爛尾病。
4、亞甲基藍和食鹽混合使用，濃度分別為2毫克/升和10毫克/升，對倒刺鲃的水霉病有較好的治療作用。
在使用亞甲藍時要注意，亞甲藍可以作為亞硝酸鹽中毒時的解毒藥，所以有時也被用作水質改良劑;亞甲藍容易和活性碳、沸點石等吸附性濾材結合，因此最好不要在原缸中用此藥，可采用晾曬好的與原缸水等溫的新水(這一點與高錳酸鉀相同);最后就是，亞甲藍不適宜在水溫低時療效。