隨著人民生活水平的提高，對乳制品和肉制品的需求日益增加，推動了畜牧產業的發展，出現了大量的規模化的畜牧場（小區），生產規模由以前的幾十頭發展到幾百頭、幾千頭。這種規模化的集中飼養方式，有利于提高畜禽的飼養技術、防疫能力和管理水平，與傳統農戶分散飼養相比，規模化飼養能大大提高生產效率和飼養轉化率，降低生產成本，從而增加經濟效益。但這種生產方式造成了糞尿過度集中和沖洗水大量增加，給環境帶來了極大的壓力，如果不加以妥善處理，會嚴重影響到畜牧業的可持續發展。
近年來，農業污染治理已列入重要議事日程。農業污染與工業污染、城市生活污水并列為三大污染源，而畜禽糞便又是導致農業污染的主要因素之一，因此加強畜禽養殖環境建設對于治理農業污染、改善生態環境質量具有重要意義。
畜禽糞便的COD(化學蓄氧量)的排放量超出了工業廢水和生活污水的排放量。由于有規模的畜牧小區（場）處理能力和貯運能力不足，經過科學處理的糞便不足10%。在非用肥季節，畜禽糞便隨意露天堆放，糞水四溢，直接導致農民生產生活環境惡化。首先是造成水體污染，畜禽糞便的隨意排放造成水體的富營養化，滲入地下水可造成地下水硝酸鹽含量過高；其次是傳播疫病，目前由動物傳染給人的人畜共患病有一百多種，傳播的主要載體就是畜禽糞便。
從而嚴重威脅畜牧業產業的安全。可以說資源、環境已經成為畜牧業可持續發展的主要制約因素。
加強畜牧小區污染治理措施的重要意義有以下幾個方面：
1、治理畜禽糞便污染是實施農業可持續發展戰略的要求
實施可持續發展戰略是我國的基本國策，可持續發展要求在經濟發展的同時，治理環境污染，改善和提高環境質量。規模化養殖業的快速發展是以犧牲環境為代價的，這種發展模式是不可持續的，不符合可持續發展戰略的要求。通過綜合治理措施，在治理環境污染的同時，促進畜禽糞便的資源化利用，既解決污染問題，又改善土壤質量，從而達到農業可持續發展的目標。
2、畜牧污染防治是生態環境建設的一個組成部分
根據《全國生態環境建設規劃》的總體安排，各部門都要對本行業在發展中出現的環境問題提出規劃，分步實施，逐步加以解決。針對畜禽糞便污染對環境造成的嚴重危害，農業部制定了“能環工程”規劃，在規模化養殖發展較為集中的地區，建設示范工程項目，提供技術和信息服務，以點帶面，為加強畜禽養殖環境管理，提供有效解決污染問題，促進畜禽糞便資源化利用的有效途徑。
3、治理污染，保護環境
禽畜糞便雖然是嚴重的污染源，但卻又是可開發的寶貴資源。通過科學的處理和加工，便可轉化為不可缺少的生產和生活資料。英國、德國、日本、美國和原蘇聯等國家早在50年代就利用厭氧、好氧和快速烘干等方法處理城市污水和人畜糞便，既治理了污染又獲得了大量的有機肥料用于改良土壤。在工程中，禽畜糞便經過固液分離、厭氧、好氧及綜合利用等環節的處理，排出液可以達到我國農田灌溉一級排放標準（COD≤200毫克/升），從而使項目區域的污染得到治理，根本上改善了生態環境。
4、開發可再生能源，提高廣大農民的生活質量
綜合治理措施所產沼氣,作為一種可再生能源資源，無論是用做生活燃料，還是用于生產電力，都能夠減少日益枯竭的化石能源的消耗，這對減低因化石燃料利用帶來的全球氣候變化具有一定的戰略意義。
沼氣又是一種高品位能源，在我國農村經濟迅猛發展的今天，面對與衣、食、住相比能源消費相對落后的形勢，高品位能源的開發利用適應了農戶對生活條件改善的需求，為提高農民生活質量，農村建設實現小康的發展目標提供了能源保障。
此外，厭氧消化過程可以殺死各種寄生蟲卵（如鉤蟲卵、蛔蟲卵等）和多種致病菌，同時消除了惡臭，使蚊蠅失去了滋生場所，大大地降低了一些人畜共患的寄生蟲和其它疾病的交叉傳播的機率。因此，糞便無害化功能可顯著的改善農村的衛生狀況和生活環境。
5、增強畜禽養殖企業的可持續發展能力
通過糞污治理，養殖企業能夠減少禽畜發病率，增加出欄量，并提高畜禽產品的質量等級。有材料表明，僅以上兩項就可為企業增收約10%左右。此外，通過綜合防治措施中的綜合利用技術，還可利用廢棄物生產優質的有機肥料和飼料等生產物資，為企業創造了多方面的經濟效益，提高了畜禽飼養企業的生存發展能力。
6、合理利用資源，為生態農業發展增添了后勁
糞便一直是我國農業生產的主要有機肥源。但由于糞便需要肥料化處理，肥效慢，施用量大，運輸、施用不便，施用季節受限制等，導致作為有機肥料的糞便沒有得到充分的利用，而化肥的長期使用又導致了眾所周知的農業生態環境惡化。
通過對糞便多層次、多途徑的轉化，逐步地使各畜牧（場）小區在發展養殖業的同時，又成為不同規模的有機肥生產廠，在控制環境污染，改善生態環境質量的同時，為農業生產提供大量的優質有機肥料，為無公害農產品的生產提供了肥源。
防治措施中對糞污的綜合利用，可增加土壤的有機質含量，提高土壤肥力，改善土壤理化性狀，減少農業生產對化學肥料的依賴，促進農業生態系統物質和能量的良性循環。
簡言之，做為在我市農業生產中占有很大比重的畜牧業，在發展肉、蛋、奶等生產的同時，亦必須著手開展畜禽糞便的處理和資源化利用，這既是實施可持續發展戰略的要求，也是全國生態環境建設的一個組成部分。因此，為促進農村經濟健康、穩定、持續的發展，有計劃、有步驟地在畜禽養殖場、畜牧小區開展污染綜合防治措施建設勢在必行。